经国务院第二次全国土地调查领导小组第一次全体会议审议通过的《总体方案》，明确了第二次土地调查的目标是全面查清全国范围内的土地利用状况，掌握真实的土地基础数据，建立和完善中国土地调查、土地统计和土地登记制度，实现土地资源信息的社会化服务，满足经济社会发展及国土资源管理的需要。

第二次土地调查的主要任务包括开展农村土地调查，查清全国农村各类土地的利用状况；开展城镇土地调查，掌握城市建成区、县城所在地建制镇的城镇土地状况；开展基本农田状况调查，查清全国基本农田状况；建设土地调查数据库，实现调查信息的互联共享。在调查的基础上，建立土地资源变化信息的调查统计、及时监测与快速更新机制。

按照《总体方案》，２００７年１月开始启动第二次土地调查工作，１月至６月开展第二次土地调查的有关准备工作，完成调查方案编制、技术规范制定，以及试点经验总结、业务培训和舆论宣传等。７月１日全面启动调查工作，２００９年上半年完成调查工作。